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新的掃描探針技術(shù)揭示礦石中的始太古代生命
來源: | 作者:T. Hassenkam, M. P. Andersson, K. N. Dalby, D. M. A. Mackenzie, M. T. Rosing | 發(fā)布時間: 3110天前 | 1446 次瀏覽 | 分享到:
Nature雜志近日在線發(fā)表了題為“Elements of Eoarchean life trapped in mineral inclusions”的研究文章,研究人員首次使用納米級紅外光譜技術(shù)(AFM-IR)原位研究了Isua沉積巖中類液相包裹物的紅外光譜和紅外吸收分布,證實了太古時代有機殘留物的存在,這一研究結(jié)果為地球地質(zhì)記錄中最古老的生物碳遺跡存在于格陵蘭西部的Isua沉積巖中提供了有力證據(jù)。由此可以推斷在37億年前的地球上已經(jīng)出現(xiàn)生命體。

文章的作者是丹麥哥本哈根大學化學系納米科學中心的T. Hassenkam, M. P. Andersson和K. N. Dalby, 丹麥科技大學微電子與納米技術(shù)系納米石墨烯中心的D. M. A. Mackenzie和丹麥自然歷史博物館的M. T. Rosing。


地球上已知最古老的沉積巖的年齡約38億年,為格陵蘭西部Isua沉積巖。已知最古老的有細胞結(jié)構(gòu)的生命證據(jù)來自澳大利亞西部約35億年前的Warrawoona微生物化石群,表明地殼形成后不到3億年生物演化就開始了。但大多數(shù)地質(zhì)學家認為,最古老的原始生命和最古老的沉積巖同齡,其重要的證據(jù)是格陵蘭西部Isua沉積巖中的條帶狀鐵建造(banded iron formation, BIF)。BIF中存在貧13C的碳微粒。由于生命新陳代謝過程對元素不同同位素有所偏好,例如光合作用中生物更多使用12C而不是13C,以此可以幫助確定生物的存在;而且這些生物應(yīng)當是光合自養(yǎng)的,即類似藍藻的生物。但是輕碳同位素只能作為光合作用的間接證據(jù),之前的研究沒有能夠記錄其他生命元素(主要是氫、氧、氮和磷)在結(jié)構(gòu)上與這種碳質(zhì)物質(zhì)有關(guān)。


T. Hassenkam等人采用世界上最先進的AFM-IR納米紅外技術(shù)原位研究了嵌入在石榴石中的碳質(zhì)包裹體的紅外光譜,發(fā)現(xiàn)碳氮和碳氧鍵合結(jié)構(gòu),并且很有可能也存在磷酸鹽,而碳氫和氧氫鍵較弱,這一發(fā)現(xiàn)與生物有機物被隔離數(shù)十億年,在約500℃下熱熟化的結(jié)果十分吻合。這一研究結(jié)果為地球地質(zhì)記錄中最古老的生物碳遺跡存在于距今37億年以上的Isua沉積巖中提供了有力證據(jù)。

圖1. 石榴石打開后馬上對包裹體成像,包裹體中含有類似液體的物質(zhì)(左圖白色箭頭所示),右圖所示為含有較多固體物質(zhì)的包裹體。


包裹體中含有類液相的物質(zhì)(圖1左圖白色箭頭所示)。對類液相包裹體進行了AFM-IR光譜研究。2500-3600cm-1波數(shù)范圍內(nèi)沒有觀察到C-H,O-H吸收峰。采用幾納米厚的干酪根作為對照樣品,判斷出類液相包裹體中的C-H和O-H含量可忽略不計。 圖2 b為a形貌圖中各點在900-2200cm-1的光譜。作者觀察到9個主要紅外吸收峰,對應(yīng)8個不同的官能團。其中920 cm-1,980 cm-1源于石榴石中的Si-O鍵振動;S4.S5.S7中的1040 cm-1為P-O鍵振動,在S6,S8,S10中峰位紅移至1060 cm-1;1160 cm-1可能為P=O,說明可能含有磷酸鹽,不過C-O和C-N的振動吸收峰也在1160 cm-1附近;1100 cm-1為C-O或P-O振動;1660 cm-1為C=C振動;1715 cm-1和1840 cm-1為C=O振動吸收峰;2230 cm-1則是源于碳氮鍵C≡N。


始太古代的生命體主要是由H,C,O,N,P幾種元素,各元素所占比例不同,但都會遵循H元素最多的規(guī)律。比如鳥嘌呤(DNA的堿基)中各元素所占比例分別為38% H,27% C,19% O,14%N, 3% P。在數(shù)據(jù)中觀察到其中4種元素的存在,H元素含量非常小而未被檢測出,然而這其實與樣品的演變過程是一致的。被包裹的有機物質(zhì)經(jīng)歷了漫長的地質(zhì)時期發(fā)生轉(zhuǎn)變并失去H元素以形成更大的碳網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),最終形成石墨。在變質(zhì)過程中,各元素的比例也會發(fā)生變化,使37億年前包裹物中揮發(fā)性成分耗竭。變質(zhì)作用下包裹體和寄主巖石的溫度超過500℃,壓力約0.5 GPa。從樣品中石榴石和黑云母之間Fe2+和Mg的分布作者推算出溫度約450℃,這是由于石榴石和黑云母間的冷卻過程中不斷進行Fe-Mg交換,導致溫度略小于變質(zhì)作用的峰值溫度。這與碳質(zhì)材料的拉曼光譜碳材料溫度計法結(jié)果一致。這種長時間的高溫會使包裹物中的有機物質(zhì)老化,形成更大的高分子碳鏈結(jié)構(gòu)。由此猜想,非碳元素在石墨化過程中會遷移至碳網(wǎng)邊緣,從碳網(wǎng)中分離出來或者在邊緣形成穩(wěn)定的化學鍵。通過計算不同溫度條件下二肽與一個簡單芳香胺反應(yīng)生成芳腈的自由能,他們發(fā)現(xiàn)胺的變質(zhì)過程中腈將是最終產(chǎn)物。對腈類化合物的紅外吸收成像(圖2 c-f,2230 cm-1處的紅外吸收成像)與以上理論分析結(jié)果相吻合。圖2 c中顏色代表腈類化合物的相對密度,左下角區(qū)域,清晰的反映出腈類化合物在30-40nm邊緣處濃度更高。

 

2. 類液相包裹體的AFM-IR 光譜研究和腈類化合物分布成像


至此,作者記錄了沉積構(gòu)造中局域在數(shù)微米區(qū)域中N,O及可能的磷質(zhì)結(jié)構(gòu)與碳質(zhì)材料的鍵合結(jié)構(gòu)。紅外光譜中腈和酸酐的存在及H鍵的缺失也與處于隔離和高溫熟化下生物質(zhì)材料的特性一致。這一研究發(fā)現(xiàn)為生物痕跡存在于距今37億年以上的沉積巖中提供了有力證據(jù)。


本文中普通AFM圖像使用了Asylum Research的MFP-3D進行成像,微區(qū)光譜和化學成像使用了nano-IR系統(tǒng)。這種新的掃描探針系統(tǒng)能得到10納米級的化學信息,其工作原理是結(jié)合可調(diào)脈沖可變波長紅外激光,采用探針去檢測由紅外激光誘發(fā)的光熱誘導膨脹效應(yīng)(PTIR)來獲得超過衍射極限的紅外光譜信息。